Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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BckdkO55028 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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BckdkO55028 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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BckdkO55028 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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BckdkO55028 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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BckdkO55028 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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BckdkO55028 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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