Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrxO54751 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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