Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab33bO35963 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms