Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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