Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ArxO35085 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ArxO35085 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ArxO35085 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms