Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms