Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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