Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms