Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms