Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Zfp408H7BX78 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Zfp408H7BX78 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp408H7BX78 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp408H7BX78 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp408H7BX78 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp408H7BX78 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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