Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms