Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sclt1G5E861 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms