Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms