Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf148G3X9R7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms