Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-1G3UXB3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms