Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20517G3UVU6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms