Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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