Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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