Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms