Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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