Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc6F2Z461 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc6F2Z461 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms