Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms