Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms