Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm32255-201ENSMUST00000219456 1349 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms