Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms