Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms