Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms