Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms