Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms