Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt4B2RU40 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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