Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms