Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms