Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Grik3B1AS29 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Grik3B1AS29 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms