Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Odf2A3KGV1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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