Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms