Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms