Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rtf1A2AQ19 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rtf1A2AQ19 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rtf1A2AQ19 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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Rtf1A2AQ19 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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