Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms