Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms