Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col9a3A2ACT7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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