Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms