Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms