Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt27Q9Z320 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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