Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CcniQ9Z2V9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms