Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp5Q9Z2P8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms