Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms