Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms