Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cldn9Q9Z0S7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn9Q9Z0S7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn9Q9Z0S7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn9Q9Z0S7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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