Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip2Q9Z0H8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms