Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn4Q9WU22 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn4Q9WU22 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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